计算机科学与技术专业源于1956年学校创立的导弹系统专用计算机专业(是全国最早成立的计算机专业)，1959年成立计算机系，1996年成立计算机学院。2001年组建西安电子科技大学软件学院(是国家首批建设的35所示范性软件学院之一)。学院设有计算机科学与技术博士后科研流动站，现有“计算机科学与技术”和“软件工程”两个博士学位授权一级学科，涵盖计算机系统结构、计算机软件与理论、计算机应用技术和软件工程四个博士学位授权二级学科，4个二级学科均为省部级重点学科。2012年，计算机科学（Computer Science）首次进入ESI全球学科排名前1%；计算机科学与技术在国务院学位办一级学科评估中位列第20位；2014年在上海交大世界大学学术排名中，计算机也首次进入全球前100名，国内名列第8。
计算机系统结构（081201）
“计算机系统结构”隶属于“计算机科学与技术”一级学科，2002 年获博士学位授予权。该学科是计算机学院传统优势学科，在2011 中国大学研究生院二级学科排名中位列第8。学科现有双聘院士1人、长江学者特聘教授1人、国家“百千万人才工程”入选者1人；建设有“网络与信息安全关键技术”教育部创新团队。其中有多位专家分别在教育部计算机科学与技术教学指导委员会、教育部学科建设与专业设置专家委员会、973 计划信息领域专家组、中国计算机学会等机构任职。
本学科研究方向稳定、科研经费充足。“十一·五”以来，先后承担并完成了国家自然科学基金重点项目、“973”项目、“863”项目、国家重大科技专项、教育部重大项目、武器装备预研项目等课题，取得了一批高水平科研成果。本学科始终坚持科学研究与人才培养相结合的发展思路，初步形成了无线网络及移动计算安全、计算机外部设备、大规模数据处理等富有特色的研究方向。
计算机软件与理论（081202）
“计算机软件与理论”隶属于“计算机科学与技术”一级学科，2011年获博士学位授予权。学科现有教授10人，博导8人，具有博士学位教师占总人数90%以上，建设有“可信软件理论与技术”校优秀创新团队。其中有多位专家担任国家自然科学基金委信息科学部会评专家，并在中国计算机学会等机构任职。
本学科研究方向稳定、科研经费充足。“十一·五”以来，先后承担并完成了国家自然科学基金重点项目和国际合作重点项目、“973”项目、武器装备预研项目等重大课题，取得了一批高水平科研成果。本学科始终坚持科学研究与人才培养相结合的发展思路，初步形成了软件理论与技术、框架时序逻辑、高性能可信计算等富有特色的研究方向。
计算机应用技术（081203）
“计算机应用技术”隶属于“计算机科学与技术”一级学科，1998年获博士学位授予权。该学科是计算机学院传统优势学科，在2011中国大学研究生院二级学科排名中位列第15。学科现有双聘院士1人、新世纪优秀人才1人，教授9人，博导5人，具有博士学位教师占总人数86%以上。其中有多位专家担任国家自然科学基金委信息科学部会评专家，并在中国计算机学会等机构任职。
本学科研究方向稳定、科研经费充足。“十一·五”以来，先后承担并完成了国家自然科学基金重点项目、“863”项目、国家重大科技专项、武器装备预研项目等课题，取得了一批高水平科研成果。本学科始终坚持科学研究与人才培养相结合的发展思路，初步形成了计算智能理论与技术、计算生物信息学、等富有特色的研究方向。
软件工程（083500）
学院建设有软件工程一级学科博士点，在2012 年教育部一级学科评估中软件工程位列第34位。学科现有教授5人，博导4人，具有博士学位教师占总人数90%以上，建设有“可信软件理论与技术”校优秀创新团队。其中有多位专家担任国家自然科学基金委信息科学部会评专家，并在中国计算机学会等机构任职。
本学科研究方向稳定、科研经费充足。“十一·五”以来，先后承担并完成了国家自然科学基金重点项目和国际合作重点项目、“973”项目、武器装备预研项目等重大课题，取得了一批高水平科研成果。本学科始终坚持科学研究与人才培养相结合的发展思路，初步形成了软件理论与技术、框架时序逻辑、高性能可信计算等富有特色的研究方向。
教育技术学（040110）
教育技术学是我国教育学科群中具有重要战略地位的新兴学科既有它的学科特点，又有它的时代特色。本学科现有教授4 人，副教授2 人，青年讲师6 人，具有博士、硕士学位的教师已占到教师总数的90%以上。先后承担了国家863、教育部、总装备部等部门多项科研项目，建立了良好的科研合作关系，设立的教育技术实验室和远程教育技术研究所为本专业研究生培养提供了良好的研究与实践训练环境。
本专业注重理论与实践相结合，已培养的硕士研究生主要在国外和国内从事电子与教育产品研发的公司或机构工作，得到了用人单位的好评。
计算机技术（085211）
计算机技术是信息社会中的核心技术，也是实现现代化的关键技术之一。计算机技术包括计算机软、硬件系统的设计、开发以及与其他领域紧密相关的应用系统的研究、开发和应用，涉及计算机科学与技术学科方面的理论、技术和方法。
本学科拥有一支综合素质好、学术水平高、实践经验丰富、具有开拓创新精神的教学科研队伍。学科现有教授22人，其中双聘院士2名，硕士生导师41人，具有博士、硕士学位的教师已占到教师总数的75%以上。其中有多位专家分别在教育部计算机科学与技术教学指导委员会、教育部学科建设与专业设置专家委员会、973 计划信息领域专家组、国家自然科学基金委信息科学部会评专家组、中国电子学会和中国计算机学会等机构任职。
本学科研究方向稳定、科研经费充足，具有直接为军事电子信息系统应用软件及硬件装备平台研制、开发的显著特色。“十一·五”以来，先后承担并完成了国家科技支撑计划项目、国家自然科学基金重大项目和面上项目、”973”项目、“863”项目、国家重大科技专项、国防重大基础预研项目、国防科技预研等重大课题，取得了一批高水平科研成果，先后获得国家级科技进步奖2 项，省（部）级科技进步奖41 项。学院始终坚持科学研究与人才培养相结合的发展思路，初步形成了无线网络及移动计算安全、框架时序逻辑、高性能可信计算、计算机外部设备、大规模数据处理、智能信息处理、计算生物信息学等富有特色的研究方向。